Domaine Scientifique

STAGE Réf. : LSS_03

L’institut Laue Langevin, situe à Grenoble, est la source de neutrons européenne. Il fournit à sa communauté d’utilisateurs, des scientifiques européens de toutes disciplines, les faisceaux de neutrons et les instruments adéquates pour résoudre des questions de structure et de dynamique des matériaux à l’échelle du dixième a plusieurs centaines de nanomètres. Parmi les techniques qu’il offre, le BioSANS permet d’analyser la structure de molécules biologiques.

Afin de faciliter la planification et l’analyse des données de BioSANS, un logiciel scientifique nommé Pepsi est actuellement disponible en ligne de commande, ainsi que via une interface web ancienne, accessible à l’adresse pepsi.app.ill.fr

Activités du stagiaire

Nous recherchons un(e) étudiant(e) motivé(e) pour :

1. Développer une interface web moderne permettant de piloter l’application en ligne de commande.
2. Fournir une interface interactive 3D et 2D
3. Doit s'assurer des questions de sécurité
4. Fournir une intégration continue github/gitlab
5. Concevoir un client lourd offrant une interface comparable et compatible Linux.

L’objectif est de rendre l’application plus accessible et ergonomique, aussi bien via un navigateur qu’au sein de notre infrastructure d’analyse.

Le candidat devra justifier des compétences nécessaires dans

• la programmation et
• le développement d’interface web.

Mais également faire preuve

• d’ouverture scientifique pour comprendre l’objet de son travail
• d’une grande autonomie
• d’une bonne capacite d’organisation et de communication avec les multiples acteurs engages dans ce projet.

Il bénéficiera, au cours de ses 6 mois de stage, d’une expérience enrichissante dans un environnement d’une grande diversité culturelle et scientifique, ainsi que d’une gratification de 750 à 900 euros mensuels (en fonction du niveau d’études).

Le lieu du stage sera ILL avec des visites possibles du labo LJK UGA. Le projet sera supervisé par

• Anne Martel, ILL instrument scientist
• Erwan Le Gall, ILL, chef de l'équipe IT
• Sergei Grudinin, LJK UGA, développeur du modèle Pepsi, https://grulab.imag.fr/

Niveau d’études souhaité

BAC+5 en Informatique

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 5 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Anne Martel,

email : martel@ill.fr

Les bicouches lipidiques modèles, reconstituées à partir d’extraits de lipides polaires bactériens, constituent des systèmes fiables pour étudier les propriétés physiques des membranes bactériennes et peuvent être utilisées, par exemple, pour aider à la conception de nouveaux antibiotiques. De tels mélanges polaires naturels sous forme marquée sont des outils essentiels pour les études de diffusion neutronique des membranes biologiques ; cependant, la deutération est connue pour perturber le métabolisme des acides gras et modifier les voies de biosynthèse lipidique. Des analyses antérieures des acides gras chez Escherichia coli et Pichia pastoris ont révélé des changements significatifs au sein de différentes séries lipidiques dans des conditions de croissance deutérées, suggérant que l’incorporation du deutérium affecte directement les gènes impliqués dans le métabolisme lipidique. S’appuyant sur ces observations, ce projet vise à étudier comment la deutération, appliquée à différentes températures de croissance et à différents stades de la courbe de croissance de la bactérie Gram positive Bacillus subtilis et de la bactérie Gram négative Escherichia coli, influence les changements des compositions globales des chaînes acyles. Le projet vise également à optimiser des méthodes de spectrométrie de masse par désorption/ionisation laser assistée par matrice à temps de vol (MALDI-TOF) pour l’analyse rapide et directe d’un large éventail de compositions moléculaires au sein de l’ensemble des mélanges de phospholipides purifiés. L’étude de tels mélanges lipidiques complexes est essentielle pour recréer des modèles de membranes bactériennes hautement pertinents sur le plan biologique, en vue de travaux visant à comprendre la fonction biologique des membranes bactériennes.

Activités du stagiaire

Culture de cellules bactériennes

Extraction et purification des lipides par extraction en phase solide et par HPLC

Optimisation des méthodes MALDI-TOF pour la détermination des compositions lipidiques

Niveau d’études souhaité

BAC+4, +5 en Biochimie des lipides

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 5 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Krishna BATCHU,

email : batchu@ill.fr