Domaine Scientifique

STAGE Réf. : LSS_03

L’institut Laue Langevin, situe à Grenoble, est la source de neutrons européenne. Il fournit à sa communauté d’utilisateurs, des scientifiques européens de toutes disciplines, les faisceaux de neutrons et les instruments adéquates pour résoudre des questions de structure et de dynamique des matériaux à l’échelle du dixième a plusieurs centaines de nanomètres. Parmi les techniques qu’il offre, le BioSANS permet d’analyser la structure de molécules biologiques.

Afin de faciliter la planification et l’analyse des données de BioSANS, un logiciel scientifique nommé Pepsi est actuellement disponible en ligne de commande, ainsi que via une interface web ancienne, accessible à l’adresse pepsi.app.ill.fr

Activités du stagiaire

Nous recherchons un(e) étudiant(e) motivé(e) pour :

1. Développer une interface web moderne permettant de piloter l’application en ligne de commande.
2. Fournir une interface interactive 3D et 2D
3. Doit s'assurer des questions de sécurité
4. Fournir une intégration continue github/gitlab
5. Concevoir un client lourd offrant une interface comparable et compatible Linux.

L’objectif est de rendre l’application plus accessible et ergonomique, aussi bien via un navigateur qu’au sein de notre infrastructure d’analyse.

Le candidat devra justifier des compétences nécessaires dans

• la programmation et
• le développement d’interface web.

Mais également faire preuve

• d’ouverture scientifique pour comprendre l’objet de son travail
• d’une grande autonomie
• d’une bonne capacite d’organisation et de communication avec les multiples acteurs engages dans ce projet.

Il bénéficiera, au cours de ses 6 mois de stage, d’une expérience enrichissante dans un environnement d’une grande diversité culturelle et scientifique, ainsi que d’une gratification de 750 à 900 euros mensuels (en fonction du niveau d’études).

Le lieu du stage sera ILL avec des visites possibles du labo LJK UGA. Le projet sera supervisé par

• Anne Martel, ILL instrument scientist
• Erwan Le Gall, ILL, chef de l'équipe IT
• Sergei Grudinin, LJK UGA, développeur du modèle Pepsi, https://grulab.imag.fr/

Niveau d’études souhaité

BAC+5 en Informatique

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 5 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Anne Martel,

email : martel@ill.fr

STAGE Réf. : THEORY_01

Les bicouches lipidiques fluides constituent les éléments de base des membranes biologiques. Les dynamiques locales des molécules lipidiques dans ces bicouches ont récemment été décrites à l’aide du modèle dynamique Matryoshka (dMm), qui repose sur une convolution hiérarchique imbriquée des processus de mouvement, dérivée d’expériences de diffusion quasi-élastique de neutrons (QENS). Toutefois, le cadre actuel du modèle dMm ne s’applique plus aux arrangements lipidiques plus complexes formant des phases non lamellaires. De telles phases lipidiques sont observées dans les membranes thylacoïdiennes fonctionnelles ainsi que dans les membranes internes des mitochondries, où l’on retrouve un polymorphisme lipidique hautement dynamique : la phase lamellaire (bicouche), mais aussi des phases non-lamellaires telles que les phases hexagonales inversées (HII) ou les phases isotropes (I) [1, 2].

Les objectifs principaux de ce stage sont d’étendre le modèle Matryoshka actuel afin de décrire les dynamiques locales des molécules lipidiques dans les phases non lamellaires, en particulier dans les phases hexagonales inversées (HII) et isotropes (I).

Activités du stagiaire

1. Revue des mouvements locaux des molécules lipidiques dans les phases lipidiques non lamellaires ;
2. Calculs théoriques de la fonction de structure incohérente des neutrons (ISF) pour les phases lipidiques non lamellaires ;
3. Utilisation de l’ISF obtenue pour analyser des données expérimentales de diffusion quasi-élastique de neutrons (QENS) sur des mélanges DOPC:DOPE, reproduisant le polymorphisme membranaire.

Niveau d’études souhaité

BAC+4 en Physique et biophysique

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 3 à 5 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Dominique Bicout,

email : bicout@ill.fr

Les bicouches lipidiques modèles, reconstituées à partir d’extraits de lipides polaires bactériens, constituent des systèmes fiables pour étudier les propriétés physiques des membranes bactériennes et peuvent être utilisées, par exemple, pour aider à la conception de nouveaux antibiotiques. De tels mélanges polaires naturels sous forme marquée sont des outils essentiels pour les études de diffusion neutronique des membranes biologiques ; cependant, la deutération est connue pour perturber le métabolisme des acides gras et modifier les voies de biosynthèse lipidique. Des analyses antérieures des acides gras chez Escherichia coli et Pichia pastoris ont révélé des changements significatifs au sein de différentes séries lipidiques dans des conditions de croissance deutérées, suggérant que l’incorporation du deutérium affecte directement les gènes impliqués dans le métabolisme lipidique. S’appuyant sur ces observations, ce projet vise à étudier comment la deutération, appliquée à différentes températures de croissance et à différents stades de la courbe de croissance de la bactérie Gram positive Bacillus subtilis et de la bactérie Gram négative Escherichia coli, influence les changements des compositions globales des chaînes acyles. Le projet vise également à optimiser des méthodes de spectrométrie de masse par désorption/ionisation laser assistée par matrice à temps de vol (MALDI-TOF) pour l’analyse rapide et directe d’un large éventail de compositions moléculaires au sein de l’ensemble des mélanges de phospholipides purifiés. L’étude de tels mélanges lipidiques complexes est essentielle pour recréer des modèles de membranes bactériennes hautement pertinents sur le plan biologique, en vue de travaux visant à comprendre la fonction biologique des membranes bactériennes.

Activités du stagiaire

Culture de cellules bactériennes

Extraction et purification des lipides par extraction en phase solide et par HPLC

Optimisation des méthodes MALDI-TOF pour la détermination des compositions lipidiques

Niveau d’études souhaité

BAC+4, +5 en Biochimie des lipides

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 5 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Krishna BATCHU,

email : batchu@ill.fr

L’imagerie neutronique en champ sombre (Dark-Field Imaging, DFI) offre une sensibilité aux caractéristiques microstructurales situées en dessous de la résolution spatiale de la radiographie conventionnelle en contraste de transmission, grâce à un contraste issu de la diffusion à petits angles du rayonnement incident par ces structures. La plupart des approches établies de DFI neutronique reposent sur l’interférométrie à réseaux, qui impose des contraintes temporelles et limite le potentiel des études in situ des processus des matériaux.

L’objectif de ce projet de mémoire de Master est de concevoir, fabriquer et valider expérimentalement des masques d’absorption aléatoires à base de gadolinium (Gd) pour l’imagerie neutronique en champ sombre, et de démontrer leur sensibilité à la microstructure des matériaux.

Activités du stagiaire

Objectifs :

Conception et optimisation de masques d’absorption aléatoires

Mise en œuvre d’un protocole d’imagerie neutronique en champ sombre à masques aléatoires et traitement des données

Évaluation des performances des masques dans un dispositif d’imagerie neutronique

Validation sur des matériaux métalliques à numéro atomique élevé (Z élevé), micro-poreux, issus de la fabrication additive

Le candidat idéal aura une formation en physique expérimentale, science des matériaux ou ingénierie, avec une forte curiosité pour l’imagerie et l’analyse d’images. Une familiarité avec le traitement d’images et l’analyse de données (par exemple en Python) constitue un atout. Un intérêt marqué pour le travail expérimental, l’instrumentation et la caractérisation des matériaux est fortement encouragé. Une expérience préalable en fabrication additive ou en matériaux poreux est un avantage, mais n’est pas obligatoire.

Si tu veux, je peux aussi l’adapter pour une annonce officielle de sujet de MSc, un résumé plus court, ou une version destinée à un dossier de candidature.

Niveau d’études souhaité

BAC +4, +5 en Physique, physique appliquée, ingénierie, science des matériaux

Connaissances linguistiques

Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.

Observations

Contrat de stage conventionné de 6 mois maximum.

Merci d’envoyer votre candidature directement au tuteur du stage :

Bratislav LUKIC,

email : lukicb@ill.fr